SmartContent対応のアイテムを手動インストールした場合でも、多分SmartContentには表示されないと思います。
おそらくインストールマネージャがデータベースへの登録までやってくれているのかなぁと妄想してます。
そんな困った場合の対処法。

1.SmartContentのタブを右クリックしてComtent DB Maintenanceを選択。
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2.Re-Import Metadataにチェックを入れてAccept。
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3.全てのチェックを外す。
 親のチェックを外せば子のチェックも外れます。
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4.全てのチェックを外した後に目的のアイテムを探してチェックを入れてAccept。
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5.これでめでたくSmartContentに表示される様になります。
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